После Стамбульского Саммита глав государств-участников ОБСЕ 1999 года, Миссия ОБСЕ в Молдове получила мандат на обеспечение транспарентности вывоза и уничтожения российских боеприпасов и вооружений, и координацию финансовой и технической помощи, направленной на содействие их вывозу и уничтожению.
В 2000 - 2001 гг. Российская Федерация вывезла по железной дороге 141 единицу самоходных артиллерийских установок и другой бронетанковой техники, а также на месте произвела уничтожение 108 танков T-64 и 139 единиц другой военной техники, ограничиваемой Договором об обычных вооруженных силах в Европе (ДОВСЕ). В течение 2002 - 2003 гг., российские военные произвели уничтожение еще 51 единицы бронетанковой техники, на которую не распространялись ограничения по договору ДОВСЕ.
Миссия также осуществляла контроль и наблюдение за вывозом 11 поездов с военной техникой и 37 поездов с более чем 22 000 тоннами боеприпасов. Однако с марта 2004 года вооружение не вывозилось, 20 000 тонн боеприпасов и некоторое количество оставшейся военной техники еще необходимо вывезти.
Миссия успешно сотрудничала с представителями российских вооруженных сил, дислоцированными в регионе, в целях осуществления наблюдения и контроля над уничтожением российской военной техники, которое производилось на месте дислокации.
Инспекторы Миссии и ДОВСЕ из разных государств-участников готовы осуществить проверку процесса уничтожения и вывоза техники. ОБСЕ располагает финансовыми средствами для возмещения Министерству обороны России затрат, понесенных при вывозе вооружений в соответствии с соглашениями.
В течение многих лет Миссия принимает участие в обсуждении вопросов, связанных с повышением уровня транспарентности в военной сфере и укрепления доверия между сторонами конфликта. В первой половине 2004 года эксперты Миссии разработали набор из 14 соглашений, предлагаемых в рамках мер по укреплению доверия и безопасности (МДБ). Они были представлены молдавскому и приднестровскому руководству действующим председателем ОБСЕ в июне 2004 года.
Пересмотренный комплекс МДБ, учитывающий комментарии и предложения экспертов по контролю над вооружениями из Российской Федерации и Украины, был передан сторонам 12 июля 2005 года.
Эти предложения включают проекты соглашений о возможных сокращениях военной силы и вооружений. Комплекс МДБ также содержит предложения по расширению контактов, мониторингу предприятий по производству вооружений, совместным учениям по операциям по поддержке мира, совместным инспекциям, совместным операциям по ликвидациям последствий катастроф, а также по общим процедурам ликвидации излишков боеприпасов и стрелкового оружия.
Практически все предлагаемые меры основываются на существующих МДБ, которые оказались успешными в регионе, таких как договор ДОВСЕ, Дейтонские мирные соглашения, Венский документ 1999 года, Руководство по передовым практикам ОБСЕ в области легкого и стрелкового оружия и Документ ОБСЕ по запасам обычных боеприпасов.
Миссия ОБСЕ поддерживает меры, предпринимаемые для поощрения конструктивных дискуссий по вопросам применения комплекса МДБ и другие меры по укреплению доверия в военной сфере.
Миссия ОБСЕ в Молдове также работает в тесном сотрудничестве с Министерством обороны Молдовы над решением задач, связанных с применением передовых практик в управлении запасами малого и стрелкового оружия и боеприпасов в интересах региональной стабильности и нераспространения.